In genere si sconsiglia di pulire gli elementi filtranti ad alta efficienza, ma di sostituirli direttamente.
I filtri ad alta efficienza, siano essi utilizzati in purificatori d'aria o soffiatori d'aria fresca, non sono generalmente consigliati per la pulizia a causa della loro elevata efficienza di filtrazione. Questo perché il design e il materiale dell'elemento filtrante ad alta efficienza ridurranno significativamente la sua efficienza di filtrazione una volta che la polvere sarà satura, e potrebbero persino influenzare l'efficienza di passaggio dell'aria fresca a causa dell'intasamento. Inoltre, i tentativi di pulire il filtro ad alta efficienza potrebbero causare l'intasamento delle particelle all'interno del filtro, esacerbandone il degrado delle prestazioni. Pertanto, per gli elementi filtranti ad alta efficienza, è più consigliabile sostituire direttamente il nuovo elemento filtrante per garantire il normale funzionamento e l'effetto di filtrazione dell'apparecchiatura.
Sebbene alcuni elementi filtranti a media efficienza e a efficienza primaria possano essere puliti secondo i requisiti del produttore, ciò non si applica agli elementi filtranti ad alta efficienza. Pertanto, quando si esegue la manutenzione di tali apparecchiature, si dovrebbe prestare particolare attenzione a distinguere i diversi tipi di elementi filtranti e a seguire le raccomandazioni del produttore per garantire le prestazioni e la durata dell'apparecchiatura.